你好,丽莎,
谢谢你的夸奖，祝贺你预定了一次很棒的日本之旅。这会很棒的。就你所描述的情况而言，似乎最好不要使用JR通票。
然而，不清楚的是:你是否必须从东京坐火车回到大阪再飞回檀香山?如果是这样的话，JR通票最终会比来回支付新干线更便宜。
JR通票只能在火车上使用。所以在东京，你可以在山手线使用它，但不能在地铁上使用。你需要购买地铁票。

玩得开心。